Facturación electrónica obligatoria en España: qué es (y en qué se diferencia de Verifactu)

Verifactu y "factura electrónica obligatoria" se citan constantemente como si fueran lo mismo, y no lo son. Son dos normativas distintas que persiguen objetivos distintos, aunque las dos afectan a cómo factura tu clínica y las dos han sufrido retrasos que no han ayudado a aclarar las cosas. Vamos a separarlas.

Verifactu: control antifraude, factura a factura

Como explicamos en nuestro post sobre la nueva normativa Verifactu, esta regulación (RD 1007/2023) busca que ninguna factura emitida se pueda alterar u ocultar después. Afecta a cómo funciona internamente tu programa de facturación, sea cual sea el formato en que envíes la factura a tu paciente: PDF, papel o electrónica.

Factura electrónica B2B: comunicarse en un formato estructurado y verificable

La "Ley Crea y Crece" (Ley 18/2022) va por otro camino: obliga a que las facturas entre empresas y autónomos (B2B) se emitan en un formato electrónico estructurado (piensa en Facturae, no en un PDF adjunto a un email) y, en muchos casos, a través de plataformas que permiten verificar cuándo se ha recibido y pagado esa factura. El objetivo aquí no es solo antifraude: es reducir la morosidad y digitalizar de verdad las relaciones comerciales entre negocios.

El calendario, actualizado tras el nuevo reglamento

Este es el punto donde más ha cambiado el panorama recientemente. El Real Decreto 238/2026, publicado en el BOE el 31 de marzo de 2026 y en vigor desde el 20 de abril de 2026, ha reescrito por completo las fechas que circulaban hasta entonces (las que hablaban de enero o julio de 2026 ya no son válidas). El calendario definitivo depende ahora de una orden ministerial de desarrollo todavía pendiente de publicación, que es la que marca el punto de partida real:

• Empresas con una facturación superior a 8 millones de euros — obligadas 12 meses después de la entrada en vigor de esa orden.
• El resto de empresarios y profesionales —donde encaja la inmensa mayoría de clínicas de fisioterapia— 24 meses después.
• Las personas físicas en régimen de atribución de rentas con facturación reducida cuentan además con un margen adicional de hasta 12 meses.

Traducido: si tienes una clínica de fisioterapia, casi con toda seguridad vas a caer en el plazo más largo, el de 24 meses desde que se publique esa orden ministerial. Conviene vigilar la fecha exacta cuando se confirme, porque a partir de ahí empieza a correr el reloj.

¿Te afecta si la mayoría de tus facturas van a particulares?

Aquí está el matiz que más tranquiliza a los fisioterapeutas: la Ley Crea y Crece regula las relaciones B2B, es decir, entre empresas y autónomos. Si tu clínica factura sobre todo a pacientes particulares (personas físicas que no actúan como empresa), esas facturas quedan, en principio, fuera del ámbito estricto de esta ley — aunque sí te siguen afectando plenamente las obligaciones de Verifactu, que no distingue entre cliente particular o empresa.

Donde sí entra en juego la factura electrónica B2B es en tus propias compras y contrataciones como negocio: facturas de proveedores, alquiler del local, aseguradoras, otros profesionales que te facturan a ti. Con el tiempo, es razonable esperar que buena parte de esas relaciones también se muevan a formato electrónico estructurado.

Este contenido es informativo y refleja el estado de la normativa a septiembre de 2026. Al no estar publicada aún la orden ministerial de desarrollo, algunos plazos concretos pueden variar — consulta con tu gestoría antes de tomar decisiones basadas en fechas específicas.

Preguntas frecuentes sobre facturación electrónica obligatoria

¿Tengo que emitir ya facturas electrónicas a mis pacientes?

No. La Ley Crea y Crece regula las relaciones entre empresas y autónomos (B2B); las facturas a pacientes particulares no entran en su ámbito estricto, aunque sí deben cumplir Verifactu igualmente.

Un PDF que envío por email, ¿ya es una factura electrónica?

No en el sentido de esta ley. Una factura electrónica "de verdad" usa un formato estructurado (como Facturae) que un sistema informático puede leer, procesar y verificar automáticamente, no solo un documento visual como un PDF.

¿Cuándo sabré la fecha exacta que me aplica?

En cuanto se publique la orden ministerial de desarrollo del Real Decreto 238/2026, que es la que fija el punto de partida de los plazos de 12 y 24 meses. Merece la pena revisarlo periódicamente o dejar que tu software de gestión lo siga por ti.

Una sola plataforma para no tener que perseguir dos normativas por separado

La buena noticia es que, si tu software de gestión está bien planteado, no tienes que gestionar Verifactu por un lado y la factura electrónica por otro como si fueran dos proyectos distintos. En MiFisio Agenda construimos el módulo de facturación pensando en ambos frentes a la vez: cumplimiento del Reglamento de Sistemas Informáticos de Facturación desde ya, y una arquitectura preparada para incorporar el formato electrónico estructurado en cuanto la orden ministerial fije el calendario definitivo. Un único sitio donde factura, agenda y fichas de pacientes conviven, en lugar de ir sumando programas sueltos.

Y si te preocupa más el día a día de la clínica que la letra pequeña de un reglamento, hemos dedicado un post a eso: Adiós a las hojas de cálculo: cómo digitalizar tu clínica de fisioterapia sin complicarte la vida.

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